Выявленные запасы сапропеля в России составляют около 225 млрд. м3. Месторождения сапропеля размещены преимущественно в лесной зоне, в зоне бывшего оледенения. Количество озерных месторождений сапропеля составляет около 50 тысяч. Мощность сапропелевых отложений в лесной полосе изменяется от 3 до 10 м, доходя иногда до 40 м (озеро Сомино в Ярославской области).

С увеличением водообмена зольность сапропелей растет, в бессточных озерах образуются мало- и среднезольные сапропели, минеральная часть которых в основном состоит из двуокиси кремния. Они богаты азотом и мощность их, как правило, весьма значительна (до 20 и более метров).

Например, на территории Ленинградской области 1360 озер содержат сапропель, прогнозные запасы которых составляют более 1,5 млрд. тонн, причем наблюдается их ежегодный прирост, что приводит к эвтрофикации водоемов и интенсивному заболачиванию озер.

В этих случаях добыча сапропеля просто экологически необходима.
Изученность сапропелевого фонда в России весьма недостаточна. Сегодня можно говорить лишь о прогнозных запасах, исходя из количества озер, среднестатистических данных по толщине отложений и отношению площади, занимаемой сапропелем, к величине зеркала озер.