Промышленное использование сапропелей осуществляется на ряде производств: химическом, биотехнологическом, строительном, металлургическом, а также при проведении буровых работ.

В промышленном производстве используются сапропели органического и органо-минералъного классов, химическом и биотехнологическом - органического класса.

В строительном производстве используются сапропели органо-минерального класса, а также органические сапропели для производства клеев, связующих и породообразующих добавок.

В настоящее время наиболее широко используется сапропель в сельскохозяйственном производстве: мелиорация малопродуктивных земель, земледелие, растениеводство, животноводство.

Применяются все классы сапропелей и озерные илы. Наиболее широко сапропелевое сырье используется для производства сапропелевых и торфо-сапропелевых удобрений в россыпном и гранулированном виде, различных компостов и грунтов на основе сапропелей, торфа и отходов животноводства, а также в виде минерально-витаминных кормовых добавок. Для этих целей наиболее пригодны сапропели органического и органо-минерального классов.
Производство, хранение и применение сапропеля не приводит к загрязнению окружающей среды.

Необходимо добавить, что разработка сапропеля при соблюдении норм выработки несет на себе также функцию оздоровления озерных водоемов, что позволит на разрабатываемых местах создать рыборазводные хозяйства, использовать водоем иным образом.